Aktivitas Konsil LSM Indonesia adalah sebagai berikut:
- Membela dan memperjuangkan nilai-nilai, tujuan dan kepentingan LSM pada umumnya dan LSM anggota pada khususnya dan mewakili mereka dalam berbagai forum pemerintah, lembaga penyandang dana, pihak swasta dan pihak-pihak lain.
- Mendorong lahirnya dan melakukan advokasi kebijakan untuk menjamin terciptanya lingkungan yang kondusif yang menunjang akuntabilitas LSM.
- Mengembangkan kerjasama dengan pihak luar dan di antara anggota-anggotanya, serta membantu pengembangan program serta aktivitas anggota.
- Mempromosikan dan merekomendasikan anggota-anggotanya kepada para pihak dan mitra strategis.
- Melakukan fungsi pengembangan kapasitas untuk memperkuat akuntabilitas anggota-anggotanya.
- Memberikan berbagai pelayanan publikasi dan informasi kepada anggota-anggotanya.
- Mempromosikan gagasan dan penerapan kode etik Konsil LSM Indonesia pada komunitas LSM Indonesia.
- Mendorong lahirnya regulasi yang menjamin posisi dan peran LSM serta akses sumber daya LSM dari berbagai pihak secara akuntabel.
- Membangun kemitraan yang setara dan efektif antara LSM, Pemerintah dan Swasta.